38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2603 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  48.8 
 
 
821 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  100 
 
 
771 aa  1575    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  51.46 
 
 
779 aa  718    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  54.51 
 
 
709 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  46.18 
 
 
811 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  44.87 
 
 
820 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  44.4 
 
 
811 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 
786 aa  419  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  46.4 
 
 
807 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 
811 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  44.69 
 
 
813 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  47.05 
 
 
817 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  44.47 
 
 
814 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  43.03 
 
 
812 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  46.06 
 
 
812 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  43.46 
 
 
807 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  45.53 
 
 
816 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  44.06 
 
 
814 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  45.66 
 
 
812 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  46.07 
 
 
794 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 
850 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 
823 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  42.27 
 
 
790 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  43.95 
 
 
791 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 
871 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  39.17 
 
 
766 aa  375  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  40.94 
 
 
900 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  39.16 
 
 
862 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  40.75 
 
 
907 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  40.19 
 
 
902 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  34.85 
 
 
682 aa  283  6.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
485 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 
472 aa  249  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  35.12 
 
 
485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  35.7 
 
 
471 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 
1162 aa  49.3  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  22.22 
 
 
706 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  43.86 
 
 
537 aa  47.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>