34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0536 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  96.56 
 
 		 407 aa  814    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  96.31 
 
 		 407 aa  811    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  100 
 
 		 407 aa  840    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  81.08 
 
 		 407 aa  699    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  64.07 
 
 		 580 aa  592  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  48.01 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  46.27 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  43.37 
 
 		 518 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  44.5 
 
 		 495 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  40.66 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  40.5 
 
 		 484 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  42.46 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  41.62 
 
 		 457 aa  309  5e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  41.62 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  40.41 
 
 		 456 aa  298  8e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  40.46 
 
 		 457 aa  294  1e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  43.15 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  38.66 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  39.35 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  38.54 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  36.16 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  37.7 
 
 		 448 aa  242  9e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  30.73 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  30.75 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  29.5 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 1000 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 1006 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 994 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  22.53 
 
 		 744 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 1162 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  21.52 
 
 		 744 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  20.39 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1116  alpha amylase domain-containing protein  22.15 
 
 		 654 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>