30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1267 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  100 
 
 		 490 aa  1014    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  37.45 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  34.92 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  32.23 
 
 		 400 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  28.95 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  32.84 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  27.95 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  29.5 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  29.12 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  32.82 
 
 		 407 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  30.79 
 
 		 447 aa  163  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  28.71 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  32.64 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  30.33 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  28.95 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  30.62 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  29.16 
 
 		 457 aa  153  8e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  28.97 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  30.77 
 
 		 580 aa  147  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  28.06 
 
 		 397 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  27.57 
 
 		 416 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  29.86 
 
 		 378 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  30.36 
 
 		 448 aa  133  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  28.64 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  26.32 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  30.23 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  27.83 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>