27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1868 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
395 aa  835    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  37.31 
 
 
397 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  34.33 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  34.24 
 
 
518 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  33.5 
 
 
495 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  32.12 
 
 
487 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  33.17 
 
 
416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  31.92 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  31.84 
 
 
400 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  31.5 
 
 
407 aa  199  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  32.24 
 
 
407 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  30.98 
 
 
407 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  30.73 
 
 
407 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  31.9 
 
 
457 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  29.56 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  28.87 
 
 
580 aa  179  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  31.39 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  30.3 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  30.65 
 
 
444 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  30.89 
 
 
457 aa  170  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  29.04 
 
 
456 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  29.66 
 
 
484 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  27.53 
 
 
448 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  27.45 
 
 
378 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  25.17 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  22.76 
 
 
672 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>