37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0538 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  100 
 
 		 398 aa  828    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  68.51 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  47.76 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  45.09 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  47.26 
 
 		 407 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  46.77 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  46.97 
 
 		 518 aa  368  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  46.27 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  46.62 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  43.25 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  46.1 
 
 		 484 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  44.67 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  44.68 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  44.19 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  41.73 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  43.33 
 
 		 484 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  42.79 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  42.09 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  42 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  39.18 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  38.62 
 
 		 487 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  35.62 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  31.92 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  30.92 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  30.15 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  20.95 
 
 		 749 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  20.95 
 
 		 749 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  22.66 
 
 		 744 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 1006 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  21.92 
 
 		 743 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  26.43 
 
 		 361 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  21.94 
 
 		 686 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  25.18 
 
 		 706 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 1000 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 		 744 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  23.1 
 
 		 747 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>