30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0836 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  100 
 
 
484 aa  1017    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  51.57 
 
 
484 aa  535  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  38.55 
 
 
518 aa  348  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  34.92 
 
 
490 aa  323  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  43.81 
 
 
400 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  37.71 
 
 
495 aa  318  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  40.66 
 
 
407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  40.79 
 
 
407 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  40.4 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  40.66 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  43.33 
 
 
398 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  38.38 
 
 
444 aa  303  5.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  40.38 
 
 
580 aa  301  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  42.86 
 
 
457 aa  300  4e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  42.08 
 
 
457 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  42.04 
 
 
457 aa  296  6e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  41.88 
 
 
456 aa  295  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  39.3 
 
 
447 aa  293  7e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  40.93 
 
 
397 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  38.58 
 
 
428 aa  262  8.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  36.25 
 
 
416 aa  246  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  36.24 
 
 
448 aa  239  8e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  35.82 
 
 
487 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  26.37 
 
 
378 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  29.66 
 
 
395 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 
376 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
994 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
554 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
554 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  33.33 
 
 
572 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>