26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0537 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  100 
 
 		 378 aa  776    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  49.87 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  30.92 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  30.92 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  31.96 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  30.71 
 
 		 495 aa  162  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  32.65 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  25.64 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  26.37 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  30.75 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  31.25 
 
 		 407 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  31.07 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  30.75 
 
 		 444 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  28.21 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  29.55 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  26.89 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  30.03 
 
 		 580 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  27.59 
 
 		 518 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  27.45 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  29.86 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  29.19 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  26.58 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  28.28 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  30.28 
 
 		 457 aa  116  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  28.78 
 
 		 457 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  28.45 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>