26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0437 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  100 
 
 
400 aa  838    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  68.51 
 
 
398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  49.25 
 
 
407 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  48.76 
 
 
407 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  48.26 
 
 
407 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  48.43 
 
 
518 aa  377  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  48.01 
 
 
407 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  48.06 
 
 
495 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  44.42 
 
 
580 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  46.68 
 
 
484 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  46.13 
 
 
457 aa  333  3e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  42.42 
 
 
397 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  45.34 
 
 
457 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  45.97 
 
 
457 aa  325  9e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  45.48 
 
 
456 aa  325  1e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  42.31 
 
 
444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  43.81 
 
 
484 aa  319  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  39.95 
 
 
447 aa  309  6.999999999999999e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  42.67 
 
 
416 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  40.77 
 
 
428 aa  297  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  40.41 
 
 
487 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  39.79 
 
 
448 aa  271  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  31.84 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  30.92 
 
 
378 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 
376 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  31.96 
 
 
490 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>