34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1966 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  100 
 
 		 447 aa  925    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  64.77 
 
 		 444 aa  618  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  40.37 
 
 		 495 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  43.61 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  43.32 
 
 		 484 aa  315  9e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  41.73 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  39.95 
 
 		 400 aa  309  8e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  43.15 
 
 		 407 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  39.3 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  43.15 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  42.89 
 
 		 407 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  40.58 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  39.82 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  37.72 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  38.31 
 
 		 457 aa  273  6e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  41.12 
 
 		 457 aa  272  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  39.04 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  37.65 
 
 		 580 aa  260  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  38.58 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  35.61 
 
 		 428 aa  230  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  36.16 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  29.56 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  30.98 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  37.06 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  31.96 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  31.62 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 994 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 		 1006 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 		 1000 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  23.98 
 
 		 672 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  22.65 
 
 		 766 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 813 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  21.07 
 
 		 728 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  23.05 
 
 		 729 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>