30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0011 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  100 
 
 
580 aa  1174    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  66.21 
 
 
407 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  64.99 
 
 
407 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  64.3 
 
 
407 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  62.7 
 
 
407 aa  586  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  45.09 
 
 
398 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  44.19 
 
 
400 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  43.99 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  39.07 
 
 
518 aa  332  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  41.71 
 
 
484 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  40.62 
 
 
484 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  40.63 
 
 
397 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  38 
 
 
457 aa  297  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  37.47 
 
 
456 aa  282  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  37.95 
 
 
457 aa  279  8e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  36.99 
 
 
457 aa  276  9e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  34.53 
 
 
428 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  36.6 
 
 
444 aa  267  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  37.98 
 
 
447 aa  261  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  34.34 
 
 
487 aa  257  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  36.77 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  34.09 
 
 
448 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  28.87 
 
 
395 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 
376 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  30.77 
 
 
490 aa  140  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  29.74 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  22.47 
 
 
749 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  22.47 
 
 
749 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  27.21 
 
 
361 aa  48.5  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 
1000 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>