30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0171 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  100 
 
 		 448 aa  935    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  45.38 
 
 		 456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  46.51 
 
 		 457 aa  328  9e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  44.5 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  45.74 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  44.36 
 
 		 518 aa  323  3e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  39.79 
 
 		 400 aa  286  7e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  39.15 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  40.2 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  40.22 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  39.11 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  37.4 
 
 		 407 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  37.7 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  36.96 
 
 		 484 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  35.62 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  36.88 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  37.57 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  34.54 
 
 		 580 aa  247  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  36.5 
 
 		 428 aa  235  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  34.87 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  36.39 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  32.89 
 
 		 487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  27.53 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  35.81 
 
 		 490 aa  134  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  28.45 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 		 1162 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 1000 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 1006 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 994 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>