48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2118 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  838    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  63.32 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2345  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2119  hypothetical protein  24.88 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0970  hypothetical protein  26.71 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0360823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4810  hypothetical protein  26.1 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1962  hypothetical protein  25.94 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2911  hypothetical protein  25.17 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2966  hypothetical protein  26.2 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1131  hypothetical protein  24.77 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  24.91 
 
 		 829 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11021  hypothetical protein  25.55 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.879161 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1071  hypothetical protein  26.98 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  22.19 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 1000 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0324  hypothetical protein  25.98 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.430404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0317  hypothetical protein  25.98 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0492  hypothetical protein  23.32 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  28.66 
 
 		 736 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12151  hypothetical protein  23.32 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  28.88 
 
 		 902 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 744 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  21.65 
 
 		 1042 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  21.59 
 
 		 1162 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  27.27 
 
 		 812 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 994 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  21.39 
 
 		 749 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  21.39 
 
 		 749 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 816 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 1006 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  23.81 
 
 		 686 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  25.38 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  20.06 
 
 		 747 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 609 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  25.38 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  22.22 
 
 		 588 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  25.76 
 
 		 812 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 823 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  25.54 
 
 		 695 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  27.22 
 
 		 672 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 485 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  27.22 
 
 		 672 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 722 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 1187 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 1022 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>