13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0448 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1116  alpha amylase domain-containing protein  52.66 
 
 		 654 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0448  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 659 aa  1355    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0415  alpha amylase domain-containing protein  44.09 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1400  glycoside hydrolase family 57  43.01 
 
 		 633 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3268  alpha amylase domain-containing protein  39.76 
 
 		 638 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2964  glycoside hydrolase family protein  40.94 
 
 		 640 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  23.61 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  27.05 
 
 		 672 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  27.05 
 
 		 672 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  22.46 
 
 		 361 aa  47.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  25.42 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  20.63 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  26.96 
 
 		 457 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>