More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0988 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  39.55 
 
 		 144 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  42.4 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  42.16 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  28.85 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  34.92 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.76 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  29.12 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  33.63 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.65 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  33.09 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  29.8 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  34.17 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  33.55 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  37.6 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  33.86 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  35.11 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  30.71 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  30.87 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  37.17 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  34.85 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.73 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  26.92 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>