More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1310 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1310  CBS  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  51.16 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  42.79 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  42.92 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  40.28 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.64 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  37.55 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  38.56 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  35.21 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  37.83 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  40.45 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  34.88 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.27 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.91 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.65 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.9 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.63 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.22 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  37.67 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.95 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.95 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  40 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  34.6 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.13 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  27.4 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  28.11 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.93 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  26.85 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  36.36 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  39.68 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.89 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  40.15 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  35.46 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.57 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  30.89 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  39.17 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  35.33 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  34 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.26 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  36.22 
 
 		 282 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  29.25 
 
 		 140 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.33 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 		 141 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  28.77 
 
 		 147 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.6 
 
 		 495 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.87 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.87 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.95 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.54 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  34.17 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.35 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  34.9 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  37.01 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.37 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.7 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  26.74 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  30.95 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  29.55 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  30.61 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  29.69 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  28.86 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.38 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  28.79 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.6 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  36.23 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.37 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  27.66 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>