More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2729 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  44.85 
 
 
1133 aa  927    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  44.77 
 
 
1130 aa  912    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1119 aa  2256    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  42.71 
 
 
1207 aa  795    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
937 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  41.37 
 
 
1127 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  43.14 
 
 
1526 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.85 
 
 
1177 aa  379  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  38.69 
 
 
1111 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  38.53 
 
 
1128 aa  364  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  38.66 
 
 
1018 aa  318  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1096 aa  315  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 
967 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 
967 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  55.56 
 
 
1805 aa  308  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  39.34 
 
 
1016 aa  302  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1058 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  39.04 
 
 
872 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34 
 
 
674 aa  277  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  33.76 
 
 
730 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
1172 aa  256  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  34.66 
 
 
608 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.72 
 
 
968 aa  249  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
608 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 
608 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
646 aa  245  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.78 
 
 
631 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
823 aa  243  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 
1130 aa  241  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
687 aa  240  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
1180 aa  239  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
816 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
912 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
645 aa  238  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  38.77 
 
 
797 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  40.97 
 
 
354 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
817 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.84 
 
 
853 aa  235  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
977 aa  235  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1274 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
717 aa  233  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
1479 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  31.42 
 
 
1001 aa  233  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
631 aa  232  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
750 aa  232  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
1156 aa  231  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1195 aa  231  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
935 aa  231  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
870 aa  231  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  32.1 
 
 
651 aa  231  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
731 aa  230  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
835 aa  230  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
916 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1362 aa  229  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.8 
 
 
659 aa  228  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.74 
 
 
1346 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
913 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.47 
 
 
661 aa  226  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  31.14 
 
 
742 aa  225  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  32.5 
 
 
755 aa  225  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1977 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
721 aa  224  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
667 aa  224  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1287 aa  224  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.54 
 
 
1361 aa  224  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
759 aa  224  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
827 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1853 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
944 aa  224  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1013 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1313 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
1124 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
1026 aa  222  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  37.06 
 
 
758 aa  222  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
643 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.46 
 
 
763 aa  221  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
944 aa  221  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1226 aa  221  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 
589 aa  220  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
868 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
791 aa  220  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.89 
 
 
772 aa  220  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.47 
 
 
982 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
643 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
643 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  27.31 
 
 
998 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
690 aa  218  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
995 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1820 aa  217  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.93 
 
 
1109 aa  217  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  36.05 
 
 
544 aa  217  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
896 aa  217  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  26.83 
 
 
910 aa  217  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
765 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  35.59 
 
 
896 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.75 
 
 
1060 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  34.94 
 
 
732 aa  217  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  35.08 
 
 
1022 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1271 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>