More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2769 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  56.95 
 
 
287 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  49.79 
 
 
537 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  49.81 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  49.23 
 
 
522 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  48.29 
 
 
468 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  48.54 
 
 
503 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  44.29 
 
 
488 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  41.82 
 
 
417 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  44.66 
 
 
307 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  46.43 
 
 
373 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  43.08 
 
 
465 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  42.65 
 
 
247 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
292 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 
387 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  45.21 
 
 
320 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  38.94 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  41 
 
 
345 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.86 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  37.97 
 
 
279 aa  143  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  38.92 
 
 
247 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  40.29 
 
 
248 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 
258 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 
344 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  36.56 
 
 
237 aa  135  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.33 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  48.04 
 
 
227 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  41.81 
 
 
542 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
520 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
324 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
327 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.31 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
275 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
275 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
275 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
275 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
275 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  34.65 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
273 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
273 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
273 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
273 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
240 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
273 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 
273 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 
221 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
250 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 
264 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  31.51 
 
 
273 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
261 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
295 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.86 
 
 
275 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.54 
 
 
267 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
871 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
405 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.14 
 
 
571 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.4 
 
 
927 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.4 
 
 
1115 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.4 
 
 
1115 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.18 
 
 
244 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.39 
 
 
440 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
276 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.17 
 
 
260 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.94 
 
 
1115 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  34.41 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  33.17 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  38.59 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.94 
 
 
1119 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.17 
 
 
260 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  33.94 
 
 
872 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
260 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.17 
 
 
260 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
260 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.17 
 
 
260 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
260 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
260 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.99 
 
 
573 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
522 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
299 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.17 
 
 
260 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>