More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1187 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  52.63 
 
 		 641 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  55.47 
 
 		 616 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  60.71 
 
 		 656 aa  756    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  58.5 
 
 		 624 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  53.42 
 
 		 639 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  57.66 
 
 		 623 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  56.92 
 
 		 632 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  55.43 
 
 		 657 aa  678    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  56.66 
 
 		 629 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  55.45 
 
 		 627 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  58.58 
 
 		 628 aa  653    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  71.74 
 
 		 616 aa  917    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  65.99 
 
 		 629 aa  819    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  57.59 
 
 		 629 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  57.58 
 
 		 655 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  100 
 
 		 645 aa  1278    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  52.88 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  53.7 
 
 		 667 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  53.57 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  53.3 
 
 		 649 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  52.35 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  52.26 
 
 		 644 aa  611  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  52.1 
 
 		 656 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  52.58 
 
 		 651 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  51 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  52.37 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  52.31 
 
 		 647 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  52.15 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  51.99 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  52.15 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  51.44 
 
 		 642 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  49.1 
 
 		 658 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  48.88 
 
 		 648 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  60.94 
 
 		 700 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  46.93 
 
 		 652 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  48.22 
 
 		 932 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  41.76 
 
 		 699 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  40.4 
 
 		 718 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  42.33 
 
 		 587 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.95 
 
 		 587 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  42.73 
 
 		 626 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.48 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.72 
 
 		 582 aa  298  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.11 
 
 		 588 aa  294  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  41.31 
 
 		 588 aa  293  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.4 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.88 
 
 		 600 aa  290  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.53 
 
 		 598 aa  287  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.33 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.13 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.13 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.13 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.13 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.13 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.33 
 
 		 600 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.13 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.38 
 
 		 626 aa  280  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.1 
 
 		 599 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  35.36 
 
 		 642 aa  273  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.8 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.3 
 
 		 595 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  39.18 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  36.31 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.43 
 
 		 663 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.34 
 
 		 664 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  39.45 
 
 		 587 aa  267  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  39.76 
 
 		 588 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.11 
 
 		 613 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  37.1 
 
 		 587 aa  266  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.23 
 
 		 655 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.98 
 
 		 604 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  39.95 
 
 		 605 aa  264  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.65 
 
 		 605 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.33 
 
 		 619 aa  263  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.47 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.67 
 
 		 652 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40 
 
 		 638 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.18 
 
 		 604 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.77 
 
 		 660 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.99 
 
 		 651 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.89 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.6 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.52 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  33.69 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  38.48 
 
 		 647 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.89 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.41 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  36.71 
 
 		 694 aa  257  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  31.72 
 
 		 640 aa  257  6e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  41.01 
 
 		 599 aa  256  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.95 
 
 		 564 aa  256  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.04 
 
 		 666 aa  256  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 604 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.06 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  32.63 
 
 		 539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.83 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.83 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.27 
 
 		 611 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>