More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0998 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
276 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  62.83 
 
 
281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  58.43 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  53.33 
 
 
368 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  53.85 
 
 
293 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  52.77 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  53.76 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  51.62 
 
 
308 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  51.31 
 
 
277 aa  231  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  49.25 
 
 
339 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
313 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 
292 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  48.13 
 
 
441 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
292 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 
284 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  48.26 
 
 
287 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.72 
 
 
284 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  45.72 
 
 
284 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  51.87 
 
 
484 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  43.02 
 
 
289 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
296 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  42.42 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
297 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  40.86 
 
 
306 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 
352 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  46.44 
 
 
280 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  43.77 
 
 
301 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 
322 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 
403 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  39.79 
 
 
291 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  37.55 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  51.06 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.44 
 
 
475 aa  115  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  33.19 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.09 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.5 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  40.79 
 
 
272 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
268 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  34.87 
 
 
284 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
281 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 
341 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
285 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
281 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
285 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
281 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.22 
 
 
264 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  47.17 
 
 
277 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
296 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
254 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  30.52 
 
 
285 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
267 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
293 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 
242 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
285 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.08 
 
 
261 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 
268 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 
260 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
271 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  35.43 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  44.07 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  35.43 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  49.26 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.5 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  35.43 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  33.52 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  44.74 
 
 
712 aa  97.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  37.5 
 
 
364 aa  95.9  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  38.98 
 
 
280 aa  95.5  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.15 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
260 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
261 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 
273 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.15 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  46.15 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
260 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.15 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>