90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1358 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  65.12 
 
 
258 aa  339  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.25 
 
 
271 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.52 
 
 
268 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.33 
 
 
259 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.36 
 
 
286 aa  254  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.33 
 
 
258 aa  254  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.67 
 
 
260 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.59 
 
 
256 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  51.76 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.85 
 
 
255 aa  241  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50 
 
 
254 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.55 
 
 
254 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.63 
 
 
261 aa  224  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.84 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.08 
 
 
273 aa  216  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.88 
 
 
259 aa  209  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.01 
 
 
248 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.18 
 
 
271 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.61 
 
 
248 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  43.24 
 
 
267 aa  206  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.28 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.38 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.27 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.8 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.64 
 
 
263 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.62 
 
 
261 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.07 
 
 
262 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.23 
 
 
261 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.45 
 
 
309 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.31 
 
 
272 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.27 
 
 
307 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  36 
 
 
310 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.09 
 
 
309 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.91 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  33.22 
 
 
351 aa  128  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.35 
 
 
331 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.45 
 
 
435 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.96 
 
 
895 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
361 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
445 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  57.89 
 
 
997 aa  46.2  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.89 
 
 
776 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.91 
 
 
914 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.14 
 
 
646 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
612 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  58.54 
 
 
476 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 
453 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  45.07 
 
 
501 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  36.23 
 
 
670 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  57.14 
 
 
1073 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55 
 
 
492 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  53.85 
 
 
458 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
518 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  36.23 
 
 
670 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  26.79 
 
 
468 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.85 
 
 
967 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  47.62 
 
 
511 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  37.5 
 
 
413 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.26 
 
 
622 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  47.5 
 
 
1412 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.66 
 
 
495 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  41.27 
 
 
491 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  40 
 
 
488 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  32.18 
 
 
481 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  37.5 
 
 
413 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  38.33 
 
 
504 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
784 aa  43.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  32.18 
 
 
481 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  43.94 
 
 
468 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.94 
 
 
447 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.43 
 
 
468 aa  42.7  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.77 
 
 
1015 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  40.85 
 
 
495 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  37.7 
 
 
670 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0261  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.73 
 
 
384 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.14 
 
 
486 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.85 
 
 
495 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
891 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50 
 
 
466 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
769 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.85 
 
 
495 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60 
 
 
677 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  57.14 
 
 
409 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  52.38 
 
 
456 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 
488 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 
452 aa  42  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 
516 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  32.18 
 
 
481 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  51.28 
 
 
409 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>