More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1094 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  100 
 
 		 226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  45.33 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.83 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  43.58 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  42.36 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.04 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.79 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.29 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  43.78 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.54 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.54 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  47.62 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  43.69 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  41.33 
 
 		 281 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  43.56 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.71 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  43.61 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  42.6 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  38.46 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.29 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.71 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  41.7 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.59 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  42.36 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.18 
 
 		 231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  42.48 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  43.6 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37.78 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.06 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  41.28 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.94 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  37.44 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  37.05 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  40.38 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  33.94 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  42.73 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.87 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  42.59 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  42.67 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  40.18 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  36.73 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  38.12 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  44.13 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  41.71 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  39.55 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  39.45 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  39.55 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  42.44 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  37.72 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  46.05 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.81 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.29 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  42.99 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  39.56 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  42.52 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  38.25 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  40.74 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  34.23 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  43.6 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.56 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  40.79 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  40.25 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  41.94 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.38 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.12 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.11 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  41.48 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  36.32 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  39.91 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  40.74 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  38.6 
 
 		 245 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  42.99 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.28 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  39.44 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  42.01 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  38.79 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  40.18 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  37.67 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  37.84 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.44 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  37.78 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  42.92 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.91 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  40.74 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  40.74 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  38.6 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  38.6 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  37.07 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  41.55 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.23 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  39.27 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  36.89 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  42.06 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>