100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1625 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  100 
 
 		 566 aa  1145    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  52.98 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  52.44 
 
 		 569 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  49.82 
 
 		 573 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  49.82 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  44.95 
 
 		 557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  47.04 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  46.51 
 
 		 562 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  44.34 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  44.41 
 
 		 580 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  45.68 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  43.99 
 
 		 566 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  43.96 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  45.7 
 
 		 553 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  43.81 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  45.52 
 
 		 553 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  45.52 
 
 		 553 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  45.34 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  42.53 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  42.53 
 
 		 578 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  23.5 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  22.2 
 
 		 563 aa  97.4  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  22.2 
 
 		 563 aa  97.4  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  23.48 
 
 		 550 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  23.73 
 
 		 553 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.91 
 
 		 545 aa  87  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.78 
 
 		 562 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.78 
 
 		 590 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  24.29 
 
 		 557 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.78 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  23.49 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  23.08 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  22.75 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  22.68 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  21.48 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  25.54 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  22.49 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.44 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  22.58 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.15 
 
 		 561 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  21.65 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  21.7 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  24.95 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.36 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.18 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  22.32 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  23.87 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  22.4 
 
 		 564 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  21.6 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  21.6 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  21.6 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.49 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  19.88 
 
 		 581 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  24.61 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  22.63 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  24.4 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  24.4 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  24.4 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  21.28 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  21.72 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  24.34 
 
 		 543 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  23.66 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  23.66 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  28.7 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  21.93 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.32 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  21.12 
 
 		 581 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  22.56 
 
 		 577 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  20.4 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.1 
 
 		 529 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  25.36 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  22.27 
 
 		 535 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  21.68 
 
 		 556 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  22.68 
 
 		 588 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  23.35 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  23.65 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  21.95 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  24.45 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  21.37 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  22.35 
 
 		 568 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  23.62 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  24 
 
 		 583 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  22.06 
 
 		 534 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  21.1 
 
 		 566 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.57 
 
 		 565 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.73 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  22.15 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  23.08 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  22.2 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  22.06 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.34 
 
 		 581 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  19.79 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  19.26 
 
 		 570 aa  47.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  26.83 
 
 		 551 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  25.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  25.74 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  20.24 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  21.08 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  23.51 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.64 
 
 		 569 aa  43.9  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>