More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12171 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  69.2 
 
 		 446 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  76.74 
 
 		 430 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  78.26 
 
 		 444 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  72.35 
 
 		 448 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  75.92 
 
 		 451 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  78.49 
 
 		 444 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  78.49 
 
 		 444 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  913    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  64.76 
 
 		 439 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  62 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  58.81 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  57.27 
 
 		 442 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  58.2 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  58.58 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  59.08 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  59.26 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  56.67 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  57.3 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  56.02 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  56.19 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  55.61 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  56.55 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  54.92 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  51.03 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  52.05 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  51.49 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  53.91 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  53.2 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  52.86 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  51.72 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  52.81 
 
 		 444 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  48.53 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  50.91 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  49.21 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  51.94 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  49.31 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  47.87 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  48.04 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  49.3 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  47.25 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  46.77 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  42.41 
 
 		 468 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.73 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  30.63 
 
 		 478 aa  173  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.36 
 
 		 434 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.11 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  29.56 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.71 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.42 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.93 
 
 		 497 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.44 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  30.1 
 
 		 493 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  31.87 
 
 		 489 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.06 
 
 		 487 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.19 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.95 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.61 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  30.15 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.97 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  30.51 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  27.23 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  25.77 
 
 		 476 aa  116  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.24 
 
 		 468 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  25.12 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.29 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  29.21 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.17 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.17 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.98 
 
 		 510 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  27.81 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  26.82 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  25.4 
 
 		 494 aa  103  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.18 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.67 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.43 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.6 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  26.68 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.89 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  25.32 
 
 		 465 aa  95.1  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  25.6 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  26.57 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  26.88 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  27.03 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  31.51 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.73 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  35.58 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  24.72 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.14 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  27.81 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  31.96 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  25.19 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  25.15 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  27.59 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.03 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.31 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>