More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11441 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  77.11 
 
 		 203 aa  311  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  77.11 
 
 		 203 aa  311  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  76.62 
 
 		 203 aa  310  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  74.87 
 
 		 205 aa  294  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  76.65 
 
 		 203 aa  294  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  71.07 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  68.81 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  68.78 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  69.19 
 
 		 209 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  67.33 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  63.68 
 
 		 223 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  67.68 
 
 		 221 aa  244  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  69.39 
 
 		 212 aa  239  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  61.58 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  64.8 
 
 		 202 aa  234  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  64.36 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  62.38 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  64.14 
 
 		 199 aa  227  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  60.87 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  61.69 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  59.71 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  55.28 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  55.91 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  59.61 
 
 		 217 aa  207  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  58.16 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  57.87 
 
 		 215 aa  201  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  52.21 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  55.56 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 		 215 aa  185  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  56.85 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  54.27 
 
 		 227 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  53 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 218 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  50.5 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  53.3 
 
 		 196 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  51.26 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  48.22 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  51.52 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  47.72 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  51.52 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  53.42 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  47.29 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  48.28 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.48 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  48.24 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  51.21 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.27 
 
 		 239 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 232 aa  160  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.28 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 220 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>