More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0885 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
375 aa  739    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  80 
 
 
392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  71.97 
 
 
384 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  52.62 
 
 
385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  47.41 
 
 
415 aa  318  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  48.6 
 
 
391 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  50.58 
 
 
411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.29 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  49.85 
 
 
424 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  47.56 
 
 
411 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  45.55 
 
 
406 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.99 
 
 
410 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.9 
 
 
387 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  47.16 
 
 
408 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  47.4 
 
 
408 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  45.89 
 
 
396 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  43.85 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  43.53 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  47.75 
 
 
420 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.99 
 
 
405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  46.31 
 
 
397 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.09 
 
 
401 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  48.24 
 
 
397 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  48.24 
 
 
383 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  45.24 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  45.35 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  45.54 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.73 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.49 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  45.32 
 
 
401 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  43.34 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  45.24 
 
 
362 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  44.97 
 
 
376 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  44.57 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  48 
 
 
372 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.04 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  45 
 
 
402 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  45 
 
 
402 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  44.9 
 
 
366 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  45.54 
 
 
376 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.56 
 
 
404 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  42.98 
 
 
370 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  42.74 
 
 
395 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  40.42 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  40.42 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  44 
 
 
351 aa  250  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  45.17 
 
 
484 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.03 
 
 
472 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  40.79 
 
 
478 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  44.38 
 
 
377 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.69 
 
 
476 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.7 
 
 
476 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  40.61 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  41.64 
 
 
389 aa  239  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.36 
 
 
466 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.73 
 
 
476 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  40.8 
 
 
392 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.36 
 
 
471 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  39.58 
 
 
388 aa  236  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  39.77 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.04 
 
 
464 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.36 
 
 
474 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  40.96 
 
 
331 aa  232  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  40.22 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  39.22 
 
 
373 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.01 
 
 
464 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.07 
 
 
476 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.61 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  39.89 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  41.72 
 
 
495 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.69 
 
 
457 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  40.97 
 
 
489 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  40.65 
 
 
504 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  42.66 
 
 
481 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  45.15 
 
 
520 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.75 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  44.78 
 
 
503 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.87 
 
 
461 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  40.98 
 
 
535 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  43.4 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  39.66 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  38.17 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.16 
 
 
469 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  43.1 
 
 
498 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  38.48 
 
 
373 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  43.1 
 
 
498 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  43.1 
 
 
498 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.6 
 
 
477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.22 
 
 
386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  45.82 
 
 
508 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  39.76 
 
 
467 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  38.6 
 
 
514 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  38.19 
 
 
513 aa  219  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  44.07 
 
 
514 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  38.99 
 
 
382 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  38.41 
 
 
396 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.31 
 
 
492 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  37.67 
 
 
498 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  43.54 
 
 
501 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  42.56 
 
 
499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>