146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4719 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  80.66 
 
 		 221 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  77.98 
 
 		 220 aa  353  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  79.53 
 
 		 224 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  77.52 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  77.06 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  78.44 
 
 		 233 aa  351  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  76.61 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  76.61 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  75.91 
 
 		 220 aa  347  9e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.15 
 
 		 220 aa  346  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  73.3 
 
 		 222 aa  344  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  76.04 
 
 		 224 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  73.73 
 
 		 235 aa  333  9e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  72.43 
 
 		 221 aa  323  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  51.61 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  52.8 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  52.8 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  52.8 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  48.85 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.63 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.85 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.89 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  50.46 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.23 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  48.17 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.17 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  48.17 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  48.17 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  48.17 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  47.71 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  47.71 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  47.71 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  47.71 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  48.84 
 
 		 222 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 220 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  45.83 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  46.45 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  45.58 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  47.39 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  45.62 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  47.93 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  45.75 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  47.51 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  46.58 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  42.66 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  46.97 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.26 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  42.65 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  47.87 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  45.58 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  42.45 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  41.43 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  44.5 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  40.4 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.38 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  42.19 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.58 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  37.56 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.42 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.44 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.44 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  39.9 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.19 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000345367  normal  0.0902559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.6 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  24.6 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  23.97 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  25 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.12 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.96 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.12 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.74 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  23.95 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.29 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  23.72 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.12 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  21.24 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  24.06 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.66 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.77 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  22.16 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.56 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.53 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.74 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>