More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  53.08 
 
 		 367 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  56.41 
 
 		 392 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  49.62 
 
 		 368 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  47.45 
 
 		 347 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  47.58 
 
 		 326 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  47.86 
 
 		 366 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 297 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 286 aa  114  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 417 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  48.51 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 368 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 452 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.09 
 
 		 438 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 333 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  39.46 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 		 327 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.96 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.23 
 
 		 332 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50 
 
 		 321 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 501 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 259 aa  98.2  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  48.45 
 
 		 350 aa  97.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  51.76 
 
 		 335 aa  97.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 256 aa  97.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 374 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 337 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.04 
 
 		 459 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 398 aa  95.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.5 
 
 		 217 aa  94.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 432 aa  94.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.79 
 
 		 318 aa  94.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.97 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 453 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.67 
 
 		 235 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.2 
 
 		 475 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 271 aa  92.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 517 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.2 
 
 		 1048 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.79 
 
 		 331 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 315 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 342 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.12 
 
 		 270 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 366 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 374 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.91 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40 
 
 		 388 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 232 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 335 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  42.86 
 
 		 395 aa  87  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 345 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 337 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  31.49 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.44 
 
 		 393 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  37.38 
 
 		 400 aa  86.3  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15430  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.07 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 446 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.81 
 
 		 531 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 333 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  39.04 
 
 		 325 aa  85.5  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 306 aa  84.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  36.96 
 
 		 273 aa  84.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 350 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 257 aa  84  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.32 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  36.23 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  43.43 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.59 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  35.62 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 394 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 374 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  38.97 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 373 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 476 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45.36 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  47.25 
 
 		 487 aa  81.3  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  43 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 333 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>