More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0301 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0301  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.258574  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 178 aa  241  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 178 aa  230  6e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1953  ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  60.11 
 
 		 178 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 178 aa  213  9e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  52 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 176 aa  174  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  46.59 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  45.86 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  42.93 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  44.38 
 
 		 179 aa  157  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  43.43 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  43.43 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  43.58 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  46.41 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  43.43 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  44.63 
 
 		 180 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  44.63 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  44.63 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0504  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00191336  hitchhiker  0.0041563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  43.82 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  42.7 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  45.71 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  43.43 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  43.02 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  43.18 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  43.58 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0409  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0384  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  43.02 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  44.38 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  42.62 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  42.46 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  45.86 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  40.57 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  42.29 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  43.43 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  46.28 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  42.86 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>