97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3234 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  100 
 
 		 409 aa  818    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  73.01 
 
 		 393 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  74.17 
 
 		 392 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  74.23 
 
 		 392 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  75.38 
 
 		 393 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  73.08 
 
 		 393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  71.28 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  72.82 
 
 		 393 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  72.82 
 
 		 393 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  72.82 
 
 		 393 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  72.31 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  70.77 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  71.87 
 
 		 392 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  71.03 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  61.58 
 
 		 394 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  61.58 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  61.58 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  61.32 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  61.58 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  61.58 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  61.58 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  60.93 
 
 		 344 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  55.24 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  55.24 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  55.24 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  54.52 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  54.26 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  54.26 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  54.26 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  54.52 
 
 		 392 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  54.26 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  56.35 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  53.97 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  50 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  48.4 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  39.78 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  36.68 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 402 aa  215  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  34.13 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 444 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  29.62 
 
 		 456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  27.82 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  26.33 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  41.73 
 
 		 160 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  31.19 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  24.92 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1269  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  25 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  19.94 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.12 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.92 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 474 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5596  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.45 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>