78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3587 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  99.23 
 
 		 392 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  98.98 
 
 		 392 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  100 
 
 		 392 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  98.72 
 
 		 392 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  99.23 
 
 		 392 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  86.48 
 
 		 392 aa  693    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  100 
 
 		 392 aa  783    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  90.31 
 
 		 360 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  71.17 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  71.17 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  71.17 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  69.97 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  61.05 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  53.09 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  54.26 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  53.49 
 
 		 393 aa  391  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  52.97 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  53.72 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  53.99 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  52.47 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  53.72 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  53.72 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  53.72 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  53.35 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  51.69 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  51.95 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  52.21 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  47.16 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  47.16 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  47.16 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  47.16 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  47.16 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  46.91 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  47.83 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  46.36 
 
 		 344 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  34.25 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  35.75 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  30.15 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.32 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  27.74 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  23.32 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  25.7 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 444 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  29.41 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.84 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.06 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.97 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>