83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4876 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  85.58 
 
 		 431 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  825    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  86.24 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  58.15 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  57.42 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  55.42 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  30.79 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  29.81 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  30.4 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  30.87 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  30.87 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  30.45 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  30.45 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  30.87 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  30.87 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  30.81 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  31.89 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  28.28 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  28.28 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  28.61 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  32.24 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  30.08 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  29.81 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  31.84 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  31.34 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  30.13 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  30.39 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  30.13 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  30.39 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  30.54 
 
 		 393 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  30.13 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  30.13 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  30.13 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  30.13 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  30.13 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  26.87 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  24.08 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  27 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  24.6 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  23.4 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  37.06 
 
 		 160 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  28.46 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  24.29 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  24.52 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  30.96 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.94 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.21 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  30.62 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 512 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  25.32 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1527  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  20.97 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>