118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2330 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  100 
 
 		 392 aa  780    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  81.96 
 
 		 392 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  87.15 
 
 		 393 aa  690    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  80.88 
 
 		 392 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  71.87 
 
 		 409 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  71.32 
 
 		 393 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  70.26 
 
 		 393 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  70.26 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  70.26 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  70 
 
 		 393 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  70.26 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  68.95 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  68.95 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  68.95 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  68.95 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  68.95 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  68.95 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  68.95 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  68.95 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  68.68 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  60.15 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  60.15 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  60.15 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  60.15 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  60.15 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  59.9 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  60.15 
 
 		 394 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  59.59 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  54.79 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  54.79 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  54.79 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  53.77 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  53.35 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  53.35 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  53.35 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  53.09 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  53.35 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  54.01 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  54.69 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  51.73 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  47.01 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  40.5 
 
 		 371 aa  239  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  36.07 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  33.33 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 415 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.36 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  28.92 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  23.26 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  42.75 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.06 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.2 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  20.49 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  31.17 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  31.5 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  24.67 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 427 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  24.21 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  35.48 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  35.48 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  35.48 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  35.48 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>