86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2319 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  100 
 
 		 393 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  99.49 
 
 		 393 aa  790    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  99.49 
 
 		 393 aa  790    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  85.75 
 
 		 393 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  99.49 
 
 		 393 aa  790    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  100 
 
 		 393 aa  792    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  90.33 
 
 		 393 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  90.08 
 
 		 393 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  90.33 
 
 		 393 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  89.57 
 
 		 393 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  90.33 
 
 		 393 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  99.49 
 
 		 393 aa  789    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  99.49 
 
 		 393 aa  790    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  99.49 
 
 		 393 aa  790    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  99.24 
 
 		 393 aa  788    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  72.31 
 
 		 392 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  72.26 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  72.26 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  72.26 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  72.26 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  71.03 
 
 		 409 aa  584  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  72.01 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  72.26 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  72.52 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  72.24 
 
 		 392 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  67.94 
 
 		 393 aa  560  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  68.95 
 
 		 392 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  72.09 
 
 		 344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  52.21 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  51.95 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  52.21 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  51.95 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  52.21 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  51.95 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  52.13 
 
 		 393 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  52.13 
 
 		 393 aa  391  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  52.39 
 
 		 393 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  52.39 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  52.3 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  46.49 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  36.29 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  31.52 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  33.04 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  27.8 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  26.55 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  25.54 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  31.02 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  38.28 
 
 		 160 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  24.27 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  22.42 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28.85 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  22.47 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 		 507 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.66 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  21.45 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.14 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>