63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1027 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  309  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  39.46 
 
 		 456 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  43.61 
 
 		 392 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  43.61 
 
 		 392 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  43.61 
 
 		 360 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 444 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  42.86 
 
 		 392 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  42.86 
 
 		 392 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  42.86 
 
 		 392 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  41.73 
 
 		 409 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  39.42 
 
 		 392 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 433 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  39.42 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  42.75 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  40.15 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  39.42 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  39.42 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  39.42 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  37.4 
 
 		 394 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  37.4 
 
 		 394 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  37.4 
 
 		 394 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  37.4 
 
 		 394 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  37.4 
 
 		 394 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  37.4 
 
 		 394 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  37.4 
 
 		 394 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  37.4 
 
 		 344 aa  77  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  41.04 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  33.77 
 
 		 393 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  33.33 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 431 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 431 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 431 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 431 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  38.28 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  38.28 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  41.27 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  38.28 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  35.48 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  35.48 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  35.48 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  35.48 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  35.48 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 415 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  35.22 
 
 		 392 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  27.73 
 
 		 404 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 405 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 404 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 404 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  30.39 
 
 		 402 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  29.37 
 
 		 359 aa  47.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  31.33 
 
 		 427 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 388 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>