67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2508 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  729    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  49.87 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  31.59 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  29.58 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  30.41 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  29.36 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  29.36 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  29.36 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  29.36 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  29.36 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  29.36 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  29.07 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  27.59 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  27.59 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  27.39 
 
 		 393 aa  96.3  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  27.51 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  31.06 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  29.41 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  29.61 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  29.03 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  28.36 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  31.56 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  26.76 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  26.76 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  28.32 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  28.32 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  26.76 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  28.32 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  28.32 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  28.32 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  26.76 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  28.32 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  26.76 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  26.76 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  31.29 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  28.32 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  28.32 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  26.13 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  28.2 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  28.2 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  26.94 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  25 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  24.78 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  26.08 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  32.37 
 
 		 160 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>