89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2547 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  803    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  36.66 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  37.67 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  37.11 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  37.04 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  37.03 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  37.03 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  36.49 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  36.49 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  36.76 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  36.76 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  35.46 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  35.68 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  35.68 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  35.41 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  35.01 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  35.34 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  34.47 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  35.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  34.21 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  34.21 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  34.21 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  35.66 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  34.82 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  33.95 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  35.12 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  33.51 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  33.51 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  33.51 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  33.51 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  33.51 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  33.51 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  33.78 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  35.47 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  32.7 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  33.04 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  29.92 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  28.61 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  25.89 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  24 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  25.07 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  27.2 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  34.36 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  21.94 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  21.32 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  21.1 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  23.66 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  24.41 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  21.99 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  27.33 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  27.78 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.78 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>