91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0194 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  792    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  30.34 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  29.46 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  29.02 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  29.02 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  31.27 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  28.57 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  27.2 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  30.12 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  25.47 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  27.85 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  27.13 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  28.21 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  26.86 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  26.86 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  27.13 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  26.86 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  26.86 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  26.86 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  26.86 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  26.86 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  28.21 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  28.21 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  28.21 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  28.21 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  27.91 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  27.91 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  24.81 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  24.81 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  24.81 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  24.81 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  24.81 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  24.81 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  24.81 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  26.9 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  25.2 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  25.2 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  24.93 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  24.93 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  24.93 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  24.93 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  25.07 
 
 		 344 aa  123  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  26.56 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  25.07 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  24.4 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  25.23 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  27.68 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  31.98 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  22.85 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  28.68 
 
 		 160 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.32 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  25.19 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.4 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.41 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0543  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  22.88 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.36 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>