74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00906 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  100 
 
 		 359 aa  717    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  34.13 
 
 		 409 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  32.27 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  33.23 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  30.97 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  30.97 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  30.97 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  33.83 
 
 		 392 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  33.53 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  29.82 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  30.27 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  30.45 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  30.45 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  31.76 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  33.04 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  33.04 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  33.04 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  31.28 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  30.15 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  33.04 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  33.04 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  31.28 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  31.28 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  31.28 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  33.04 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  31.76 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  33.04 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  30.15 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  31.76 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  31.76 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  33.04 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  31.76 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  33.04 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  30.15 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  30.15 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  31.28 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  31.28 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  32.13 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  30.11 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  31.63 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  30.54 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  30.88 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  27.22 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  27.52 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 392 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  28.95 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  24.41 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  22.35 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 431 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 431 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  29.37 
 
 		 160 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  25.5 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.61 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>