52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4655 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  54.08 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  55.42 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  28.06 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  23.52 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.2 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  25.45 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  25.07 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  30.2 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  25.41 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  30.32 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  24.35 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  23.1 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  23.1 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  23.1 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  23.1 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  23.1 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  23.1 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  23.1 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  29.33 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  28.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  26.2 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  22.66 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  23.05 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>