90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3834 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  100 
 
 		 371 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  38.69 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  39.78 
 
 		 409 aa  248  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  39.34 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  38.14 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  40.5 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  36.02 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  35.75 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  35.75 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  35.33 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  35.33 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  35.33 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  35.33 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  35.33 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  35.05 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  36.12 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  37.57 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  36.56 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  36.56 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  36.56 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  36.56 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  36.56 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  36.29 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  36.29 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  36.56 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  35.48 
 
 		 392 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  35.75 
 
 		 392 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  35.75 
 
 		 392 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  36.02 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  35.48 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  35.22 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  35.22 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  34.59 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  34.71 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  36.36 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  36.36 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  36.36 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  36.36 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  36.36 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  34.41 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  33.33 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  30.79 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  30.83 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  25.7 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  32.35 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  26.42 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 433 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 444 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  21.79 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.95 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  23.83 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 395 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 424 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.55 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  25.1 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.79 
 
 		 445 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.79 
 
 		 445 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4363  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 396 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>