52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0009 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  100 
 
 
392 aa  764    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  56.06 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  24.74 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  24.74 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  24.74 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  24.74 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  24.74 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  24.74 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  24.47 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  24.86 
 
 
404 aa  89.7  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  23.96 
 
 
393 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  24.73 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  23.76 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  24.4 
 
 
344 aa  86.7  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  25.07 
 
 
392 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  24.3 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  25.48 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  24.86 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  22.5 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  23.69 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  22.5 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  22.5 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  24.59 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  22.5 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  24.59 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  23.34 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  22.07 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  22.07 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  23.42 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  23.42 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  23.42 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  23.42 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  26.06 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  21.85 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  25.7 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  24.31 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  24.03 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  24.8 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  23.76 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  23.76 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  23.76 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  23.76 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  23.76 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  23.48 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  23.48 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  24.79 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  25.59 
 
 
456 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  26.03 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  22.79 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  23.58 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>