72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1269 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1269  major facilitator transporter  100 
 
 		 382 aa  766    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0463  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.44223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1788  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.05 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  22.1 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.51 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.52 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.89 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.04 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.04 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 513 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  22.62 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  25.95 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  25.95 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  25.95 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  25.95 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  25.95 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  26.95 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 397 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 525 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  24.85 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24700  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  22.34 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.63 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  26.88 
 
 		 536 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>