157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24700 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24700  major facilitator transporter  100 
 
 
392 aa  777    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  26.26 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  26.26 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  25.67 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  25.93 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  26.14 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  26.14 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  26.04 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  26.04 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  26.14 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  24.62 
 
 
422 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  26.14 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  24.23 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  25.76 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  24.19 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21310  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.67 
 
 
408 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.54 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  23.59 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  26.47 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  22.56 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  24.4 
 
 
461 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
429 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  28.37 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.06 
 
 
418 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
426 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.27 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  21.39 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  26.15 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.62 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  29.83 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.68 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.71 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  24.11 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  30.89 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.58 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.33 
 
 
391 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25.68 
 
 
400 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  28.91 
 
 
462 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.68 
 
 
398 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  23.55 
 
 
436 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
515 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.1 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  21.46 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
243 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
497 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 
508 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
424 aa  46.6  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  25.7 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.95 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.34 
 
 
424 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  24.8 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.78 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.17 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  24.58 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  24.8 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
489 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  27.2 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  33.33 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.91 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  20.69 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.46 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.46 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  23.03 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0251  sugar efflux transporter  26.28 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  24.44 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.14 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.7 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  20.69 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  20.69 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.05 
 
 
531 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  32.53 
 
 
591 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  20.41 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  19.91 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  28.95 
 
 
498 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.86 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.62 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  20.41 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  19.63 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  21.38 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  20.41 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.81 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  21.38 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  26.47 
 
 
531 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>