22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5066 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  80.94 
 
 		 428 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  81.34 
 
 		 435 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  100 
 
 		 434 aa  868    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  23.94 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  21.29 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  22.44 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  23.38 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  22.13 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  23.02 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  23.18 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  21.64 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  22.74 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  23 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.92 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  23.76 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  23.76 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  23.76 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  24.83 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  24.83 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  25.09 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  24.83 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>