76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2034 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  100 
 
 		 214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  60.84 
 
 		 144 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  50.35 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  50.35 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  41.18 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  29.86 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  32.16 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  27.62 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  34.38 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  34.38 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  28.12 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  37.25 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  34.92 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  31.58 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  32.33 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  37.04 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  34.59 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  33.79 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  38.1 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.03 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  35.82 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.65 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.98 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  31.41 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  29.94 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  36.26 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  29.85 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  27.54 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  34.55 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.55 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  29.55 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  35.48 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  27.27 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.11 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  25.53 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  32.03 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  36.17 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.4 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  31.46 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  32.65 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  27.17 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  33.86 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.23 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  31.87 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  29.23 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  24.26 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.48 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  35.87 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  29.71 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.91 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  24.77 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  38.27 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  26.87 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.6 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.87 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  25.79 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  29.13 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  35.8 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  26.04 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.59 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.12 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  32.18 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  28.03 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  28.03 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  31.11 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  27.48 
 
 		 284 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.93 
 
 		 217 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>