120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5945 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 363 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2414  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1140  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 391 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 412 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  28.47 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  27.32 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  21.92 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  21.78 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.09 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  21.93 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.2 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  31.4 
 
 		 738 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 430 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 434 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.86 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  24.56 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  29.6 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  25.46 
 
 		 451 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.91 
 
 		 410 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  29.61 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.05 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  27.27 
 
 		 469 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  28.41 
 
 		 403 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  28.48 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4013  hypothetical protein  24.57 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  21.62 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  25.89 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 397 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 427 aa  46.2  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.01 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  27.01 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  29.31 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  26.67 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  29.38 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.68 
 
 		 459 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.25 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.16 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  30.09 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 444 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.68 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  27.01 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.7 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  28.16 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  28.68 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  27.01 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>