29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1140 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1140  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  724    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2414  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  28.13 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  23.69 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  31.96 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  31.06 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  31.06 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  23.33 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7197  major facilitator superfamily permease  27.32 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  23.03 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>