74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2414 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2414  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1140  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  30.77 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.05 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  23 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.74 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  37 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  32.48 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  28.74 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  28.74 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  35.19 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.32 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  35.12 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  31.01 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  21.48 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  37.5 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 462 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  21.79 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 468 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  33.53 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  33.57 
 
 		 738 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5038  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178058  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20840  Major Facilitator Superfamily transporter  31.36 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  28.57 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>