More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3509 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.18 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  28.2 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  25.94 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  24.83 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.42 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.55 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.03 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2402  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3571  hypothetical protein  26.25 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  24.15 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.55 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  42.17 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3293  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3526  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382139  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2248  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2227  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1925  hypothetical protein  25.87 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  33.05 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  23.76 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0659  hypothetical protein  25.87 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0955  hypothetical protein  25.87 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  32.39 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  29.38 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  29.59 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3599  hypothetical protein  25.48 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  29.75 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  34.34 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 360 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>