More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2332 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 311 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  38.41 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.57 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  23.72 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  26.14 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  24.9 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.16 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  23.81 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0654  HTH-type regulatory protein, AraC family  24.8 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.88 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  29.01 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0721  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  32.08 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 530 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3152  sigma-54 factor, interaction region  30.83 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  34.58 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  25.12 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  25.37 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  24.12 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  32.61 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0886  transcriptional regulator, AraC family  21.18 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>